Rによるコレスポンデンス分析
次のような集計表があったとします。

これをコレスポンデンス分析してみましょう。
Stephane Dray氏によるCoCoAn: Constrained Correspondence Analysis をダウンロード。
解凍してlibraryにフォルダを丸ごとコピー。
Rを立ち上げて、
> library(C0CoAn);
> L <- matrix(c(4,2,1,3,2,5,1,3,2,4,3,2,2,1,3,1),4,4)
> L
> M <- CAIV(L);
> CAIV.plot(M, x=1, y=2, add.row=TRUE, add.col=TRUE, add.var=FALSE,
row.names="", col.names="", var.names="");
とすると、


ev:a vector containing eigenvalues
B:coecients of variables of E (only in constrained analysis)
D:covariance matrix between external variables and row scores (only in constrained
analysis)
R:row coordinates of unit variance
F:column coordinates of variance ev[i]

これをコレスポンデンス分析してみましょう。
Stephane Dray氏によるCoCoAn: Constrained Correspondence Analysis をダウンロード。
解凍してlibraryにフォルダを丸ごとコピー。
Rを立ち上げて、
> library(C0CoAn);
> L <- matrix(c(4,2,1,3,2,5,1,3,2,4,3,2,2,1,3,1),4,4)
> L
> M <- CAIV(L);
> CAIV.plot(M, x=1, y=2, add.row=TRUE, add.col=TRUE, add.var=FALSE,
row.names="", col.names="", var.names="");
とすると、


ev:a vector containing eigenvalues
B:coecients of variables of E (only in constrained analysis)
D:covariance matrix between external variables and row scores (only in constrained
analysis)
R:row coordinates of unit variance
F:column coordinates of variance ev[i]