奈良県天理市の崇神天皇陵の近く、天神山古墳に鎮座する古社。言い伝えを記した文書が天文年間に焼失してしまったために由緒の詳細は不明。崇神天皇の時代に伊勢神宮と同じ頃に創建されたと伝わっている。イザナギとイザナミを祀る神社は清和天皇の859(貞観元)年に神位を増進された。しかし、鎌倉時代、室町時代の時代の波に揉まれ衰退を余儀なくされた。

復興を成し遂げたのは江戸時代。柳本藩主織田修理正長種による。時は1641(寛永18)年のこと。この時に現在の場所に移された。