| 藩主 | 官位・通称 | 出自 |
| 初代 | 藤堂高通 Takamichi | 従五位下 佐渡守 | 伊勢津藩主藤堂高次の二男 |
| 2代 | 藤堂高堅 Takakata | 従五位下 備前守 | 藤堂高通の弟 |
| 3代 | 藤堂高陳 Takanobu | 従五位下 佐渡守 | 藤堂高堅の長男 |
| 4代 | 藤堂高治 Takaharu | 従五位下 大膳亮 | 藤堂高虎の弟・高清の孫に当たる宗藩一門藤堂出雲守高明の三男。伊勢津藩主を相続。 |
| 5代 | 藤堂高豊 Takatoyo | 従五位下 大膳亮 | 宗藩の一門家臣藤堂出雲守高武の三男。宗家津藩を相続し、藤堂高朗となる。 |
| 6代 | 藤堂高雅 Takamasa | 従五位下 佐渡守 | 宗藩一門・藤堂出雲守高武の四男。藤堂高豊の弟。 |
| 7代 | 藤堂高敦 Takaatsu | 従五位下 大膳亮 | 藤堂高豊の長男。宗家津藩主を相続し、藤堂高嶷となる。 |
| 8代 | 藤堂高朶 Takaeda | 従五位下 左京亮 | 藤堂高朗(高豊)の六男 |
| 9代 | 藤堂高興 Takaoki | 従五位下 弾正忠 | 藤堂高朗(高豊)の七男 |
| 10代 | 藤堂高衡 Takahira | 従五位下 佐渡守 | 宗藩一門・藤堂出雲守高周の長男 |
| 11代 | 藤堂高矗 Nakanao | 従五位下 佐渡守 | 藤堂出雲家の第6代当主・藤堂高文の孫・藤堂高璞の子。 |
| 12代 | 藤堂高兌 Takasawa | 従五位下 左近将監 | 津藩主藤堂高嶷(高敦)の三男。津藩第10代藩主となる。 |
| 13代 | 藤堂高邁 Takatoh | 従五位下 佐渡守 | 津藩主藤堂高嶷(高敦)の五男 |
| 14代 | 藤堂高秭 Takayatsu | 従五位下 佐渡守 | 津藩主藤堂高嶷(高敦)の十男 |
| 15代 | 藤堂高聴 Takayori | 従五位下 佐渡守 | 藤堂高邁の長男 |
| 16代 | 藤堂高邦 Takakuni | 従五位下 佐渡守 | 一門家臣名張領主藤堂宮内長徳の二男。
伊賀名張1万5000石領主家は初代藩主・藤堂高虎の養子・藤堂高吉(丹羽長秀の子)を祖とする。 |
