| 代数 | 当主・藩主 | 備考 |
| 1 | 蒲生惟俊 | |
| 2 | 蒲生惟賢 | |
| 3 | 蒲生俊綱 | |
| 4 | 蒲生俊宗 | |
| 5 | 蒲生重俊 | |
| 6 | 蒲生氏俊 | |
| 7 | 蒲生俊綱 | |
| 8 | 蒲生秀朝 | |
| 9 | 蒲生高秀 | |
| 10 | 蒲生秀胤 | |
| 11 | 蒲生秀兼 | |
| 12 | 蒲生秀貞 | |
| 13 | 蒲生秀綱 | |
| 14 | 蒲生貞秀 | |
| 15 | 蒲生秀行 | |
| 16 | 蒲生秀紀 | 近江音羽城主 |
| 17 | 蒲生定秀 | 近江日野城城主 |
| 18 | 蒲生賢秀 | 近江日野城主 |
| 19 | 蒲生氏郷 | 近江日野城主→伊勢松阪城主→陸奥黒川城主 |
| 20 | 蒲生秀行 | 陸奥黒川城主→下野宇都宮城主→陸奥会津藩主 |
| 21 | 蒲生忠郷 | 陸奥会津藩主 |
| 22 | 蒲生忠知 | 出羽上山藩主→伊予松山藩主 |
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