| 代数 | 当主・藩主 | 備考 |
| - | 土方信治 | 大和源氏の祖・源頼親から5代目の源親治を祖とする.織田家の家臣. |
| - | 土方雄久 | 前田利長・前田利政の従兄弟. 尾張国犬山領主→越中国布市藩主[1600-1608]→能登国石崎藩主[1608]→下総国多胡藩主[1608] |
| 1 | 土方雄氏 | 父・土方雄久の所領は弟の土方雄重が相続. 伊勢国菰野藩主[1600-1635] |
| 2 | 土方雄高 | 伊勢国菰野藩主[1635-1651] |
| 3 | 土方雄豊 | 伊勢国菰野藩主[1652-1705] |
| 4 | 土方豊義 | 伊勢国菰野藩主[1705-1719] |
| 5 | 土方雄房 | 伊勢国菰野藩主[1719-1750] |
| 6 | 土方雄端 | 伊勢国菰野藩主[1750-1758] |
| 7 | 土方雄年 | 伊勢国菰野藩主[1758-1780] |
| 8 | 土方雄貞 | 伊勢国菰野藩主[1780-1782] |
| 9 | 土方義苗 | 伊勢国菰野藩主[1780-1782] |
| 10 | 土方雄興 | 伊勢国菰野藩主[1835-1838] |
| 11 | 土方雄嘉 | 伊勢国菰野藩主[1838-1858] |
| 12 | 土方雄永 | 伊勢国菰野藩主[1858-1870] |
| 13 | 土方雄志 | 伊勢国菰野藩主[1870-1871]→廃藩置県 |
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