| 代数 | 当主・藩主 | 備考 |
| 1 | 堀直時 | 信濃飯山藩主・堀直寄の次男.分与を受けて立藩. 越後国安田藩主[1639-1643] |
| 2 | 堀直吉 | 越後国安田藩主[1643-1644]→陣屋移転→越後国村松藩主[1644-1676] |
| 3 | 堀直利 | 越後国村松藩主[1676-1711] |
| 4 | 堀直為 | 越後国村松藩主[1711-1736] |
| 5 | 堀直堯 | 越後国村松藩主[1736-1785] |
| 6 | 堀直教 | 越後国村松藩主[1785-1795] |
| 7 | 堀直方 | 越後国村松藩主[1795-1802] |
| 8 | 堀直庸 | 越後国村松藩主[1802-1819] |
| 9 | 堀直央 | 越後国村松藩主[1819-1857] |
| 10 | 堀直休 | 越後国村松藩主[1857-1860] |
| 11 | 堀直賀 | 越後国村松藩主[1860-1868] |
| 12 | 堀直弘 | 越後国村松藩主[1868-1871]→廃藩置県 |
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