| 代数 | 当主・藩主 | 備考 |
| 1 | 大久保忠常 | 相模国小田原藩主・大久保忠隣の子. 武蔵国騎西藩主[1601-1611] |
| 2 | 大久保忠職 | 武蔵国騎西藩主[1611-1632]→美濃国加納藩主[1632-1639]→播磨国明石藩主[1639-1649]→肥前国唐津藩主[1649-1670] |
| 3 | 大久保忠朝 | 肥前国唐津藩主[1670-1678]→下総国佐倉藩主[1678-1686]→相模国小田原藩主[1686-1698] |
| 4 | 大久保忠増 | 相模国小田原藩主[1698-1713] |
| 5 | 大久保忠方 | 相模国小田原藩主[1713-1732] |
| 6 | 大久保忠興 | 相模国小田原藩主[1732-1763] |
| 7 | 大久保忠由 | 相模国小田原藩主[1763-1769] |
| 8 | 大久保忠顕 | 相模国小田原藩主[1769-1796] |
| 9 | 大久保忠真 | 相模国小田原藩主[1796-1837] |
| 10 | 大久保忠愨 | 相模国小田原藩主[1837-1859] |
| 11 | 大久保忠礼 | 相模国小田原藩主[1859-1868] |
| 12 | 大久保忠良 | 相模国小田原藩主[1868-1871] |
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